厚生労働省 / 医政局 / 研究開発政策課
2025年度シート ／ 軸: FY2024 執行実績（確定している最新の予算年度）
FY2024 は歳出予算現額 104 億円 のうち 43.2 億円（41.4%）を執行。翌年度繰越 45.8 億円、不用相当額 15.4 億円。
2025年度シートの推進チーム所見は「現状通り」、翌年度要求への反映は「現状通り」。
FY2025 当初予算は 13.1 億円、FY2026 概算要求は 13.4 億円。
ループ検証（このサイト独自の判定）: 2024年度シートの反映「現状通り」に対し、FY2024 当初は 15.6 億円 → FY2025 当初 13.1 億円（−16.2%）。この反映状況は増減を約束しないため判定対象外。
「全ゲノム解析等実行計画2022」を着実に推進し、国民へ質の高い医療を届けるため、がんや難病患者を対象とした全ゲノム解析及びマルチオミックス解析等を実施することで得られる全ゲノムデータ等を搭載した質の高い情報基盤を構築し、民間企業やアカデミア等へその本格的な利活用を促し、診断創薬や新規治療法等の開発を開始する。また、解析結果等の速やかな日常診療への導入や、出口戦略に基づいた新たな個別化医療の実現についても更に推進する。
我が国における全ゲノム解析の研究やその成果の患者に対する医療への実装、研究と医療実装の好循環を進めていくため、事業実施組織においては主に下記のような役割を担う。／（１）全ゲノム解析等の結果及び成果の速やかな患者還元支援／（２）個別化医療の推進支援／（３）質の高い情報基盤の構築と運用／（４）患者・市民参画推進、国民向けの情報発信・周知活動支援／（５）ＥＬＳＩ支援／（６）人材育成支援
財源
使い道
| 予算年度 | 当初予算 | 歳出予算現額 | 執行額 |
|---|---|---|---|
| 2023 | 0 円 | 4,295,000,000 円 | 0 円 |
| 2024 | 1,560,727,000 円 | 10,437,327,000 円 | 4,317,730,561 円 |
| 2025 | 1,308,094,000 円 | 10,479,444,000 円 | 0 円 |
| FY | ① 要求 | ② 当初 | ② 現額 | ③ 執行 | ③ 執行率 | ④ 不用相当 | 出典 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2023 | — | 0 円 | 4,295,000,000 円 | 0 円 | — | 0 円 | 2025年度シート |
| 2024 | 1,868,000,000 円 | 1,560,727,000 円 | 10,437,327,000 円 | 4,317,730,561 円 | 41.4% | 1,537,996,439 円 | 2025年度シート |
| 2025 | 1,878,361,000 円 | 1,308,094,000 円 | 10,479,444,000 円 | 未確定 | — | — | 2025年度シート |
2024年度シート 所見「現状通り」 反映「現状通り」
FY2024 当初 1,560,727,000 円 → FY2025 要求 1,878,361,000 円 → FY2025 当初 1,308,094,000 円（2025年度シート）。FY2024 執行 4,317,730,561 円（41.4%） 判定: 判定対象外
2025年度シート 所見「現状通り」 反映「現状通り」
FY2025 当初 1,308,094,000 円 → FY2026 要求 1,344,265,000 円 → 翌年のシートがないため未検証
| 種別 | 指標 | 目標 | 実績 | 達成率 |
|---|---|---|---|---|
| アウトプット | プロジェクトの進捗率[%] | 80 | 70 | 87.5 |
| アウトプット | プロジェクトの進捗率[％] | 80 | 70 | 87.5 |
| アウトカム・短期 | 計画に対する達成率[％] | 40 | 70 | 175 |
| アウトカム・短期 | データの移行及び拡充 | — | — | — |
| アウトカム・長期 | 業務委託比率（プロパー、外注の比率）[％] | 0 | 0 | — |
| アウトカム・長期 | 計画に対する達成率 | — | — | — |
| E | 国立大学法人東京大学（医科学研究所） ゲノム情報および医療情報等を扱うための必要な法令等に準拠し、システム開発を行う。 | 3,347,552,000 円 |
|---|---|---|
| H | 株式会社ロビンソン IaaSサービス（Microsoft Azure）の設計・構築業務 | 2,640,000,000 円 |
| F | 株式会社ＣＬＯＵＤＯＨ 全ゲノム事業における臨床情報を集約・管理するためのデータレイク開発支援業務 他 | 1,472,156,000 円 |
| A | ＥＹストラテジー・アンド・コンサルティング株式会社 （１）厚生労働省が主体となって進めるゲノム医療に係る戦略立案に関する調査および検討を支援。（２）厚生労働省がプロジェクトマネジメントを行うシステム開発に関する支援。（３）事業実施準備室の運営に係る伴走支援。 | 851,855,000 円 |
| C | 国立研究開発法人国立がん研究センター 令和７年度中に事業を開始することを目標に、「全ゲノム解析等実行計画2022」に基づき事業実施組織の発足に関する具体的な体制整備 | 95,378,000 円 |
| I | 株式会社日立製作所 クラウド環境において運用管理業務を行うことにより、本年度から開発される各システムによる業務が遺漏なく実施され、円滑な本番環境への移行を行う。 | 13,310,000 円 |
| G | エヌ・ティ・ティ・コミュニケーションズ株式会社 各システムを配置するクラウド基盤及び当該環境と開発管理拠点を結ぶ回線敷設等のインフラ整備を実施することにより、本年度から開発される各システムの円滑な本番環境への移行を推／進する。 | 8,665,000 円 |
| J | 株式会社日立ソリューションズ 各種基準書の検討支援及び作成 | 6,600,000 円 |
| B | ＥＹ新日本有限責任監査法人 会計処理等に関する一般的・専門的助言 | 3,283,000 円 |
| K | 株式会社インターネットイニシアティブ データ保管のためのデータセンターを契約し、環境を整備することにより、事業実施準備室が進める事業計画及び手順に従った、システムならびにデータ移行を行う。 | 968,000 円 |